Султон Мирзошоев получил начальное образование в Дангаринском районе Хатлонской области, а после работал на различных должностях в Коммунистической партии советского Таджикистана. В 1966-1972 годах был председателем комитета кинематографистов, а в 1973-1979 годах был постоянным представителем Совета министров Таджикистана при Совете министров СССР. В 1979-1987 годах работал в должности министра культуры Таджикистана, а в 1989-1993 годах был первым секретарем Коммунистической партии в Кулябской области.
Был основателем и первым руководителем администрации президента Таджикистана в 1993-1994 годах и до 2007 года руководил комплексом «Кохи Вахдат».
Вообще-то, Мирзошоев в 1993 году стал пенсионером, но тогда он еще не знал, что этот выход на пенсию стал его возвращением к ответственности, к созданию правительства, которая, существует в Таджикистане и по сей день. До получения должности председателя Верховного совета Таджикистана Эмомали Рахмоном в 1993 году, Султоншоев уже имел опыт работы в различных государственных и партийных должностях.
Он в 1987 году после восьми лет работы в кресле министра культуры был уволен с этой должности вследствие скандала с Петром Лучинским, тогдашним вторым секретарем ЦК КП Таджикской ССР. Но, через два года Кулябская область была вновь образована, и Мирзошоев по решению Центрального комитета КПСС, был назначен первым секретарем компартии Кулябской области. Это было временем конца спокойствия в Таджикистане и беспокойные тучи уже были видны на небосклоне.
Сам Мирзошоев в своей последней беседе с Радио Озоди говорил, что в февральских событиях 1990 года таджикское телевидение, допустив в эфир недостоверные программы, оклеветало кулябскую молодежь, что стало причиной гневного протеста первого секретаря областного комитета партии в адрес центральных властей. Мирзошоев говорил, что после его протеста тогдашняя генеральная прокуратура провела расследование и обвинила государственное телевидение в подстрекательстве. Но, добавил, что противостояние подстрекательству продолжалось не долго.
В апреле 1992 года под предлогом защиты тогдашнего председателя Верховного совета Таджикистана Сафарали Кенджаева жителей Кулябского региона потянули на площади. Попытки остановить молодежь не увенчались успехом. 22-го апреля того же года в Кулябе по инициативе Сангака Сафарова, Мулло Абдурахим Шарифзода и Курбон Зардака был организован митинг. Они пригласили Курбонали Мирзоалиева, председателя облсовета Кулябской области и Султона Мирзошоева, первого секретаря областного комитета Компартии на площадь, чтобы они выступили перед митингующими.
Противостояния 1992 переросли в гражданскую войну. В Таджикистане уже действовали законы оружия и полевых командиров. Даже после 16-й сессии Верховного совета.
Султон Мирзошоев в своей последней беседе с Радио Озоди говорил, что на Навруз 1993 года он пригласил в гости в Курган-Тюбе одного из командиров Народного фронта Файзали Саидова, нового председателя Верховного совета Эмомали Рахмона и тогдашнего премьер-министра Абдумалика Абдуллоджанова. Эта история произошла в те дни, когда Султон Мирзошоев был приглашен Эмомали Рахмоном для создания фундамента нового правительства и администрации президента страны.
В те дни на повестке дня стоял вопрос доверия тем лицам, которые входили в новое правительство и его структуры.
В таких условиях, в 1994 году в Таджикистане состоялись президентские выборы.
Эмомали Рахмон, председатель Верховного совета и Абдумалик Абдулладжанов, бывший премьер-министр были основными кандидатами на этот пост и их предвыборные баталии протекали очень остро. По словам Султона Мирзошоева, даже с целью оказания давления на конкурентов использовали запрещенные методы. Такой момент произошел во время телевизионного обращения Эмомали Рахмона по государственному телевидению.
Эмомали Рахмон на тех выборах победил, и главный вопрос теперь заключался в создание новой команды. После назначения нового правительства в декабре того года Мирзошоев по состоянию здоровья подал в отставку с поста руководителя администрации президента. После, он работал в различных должностях, но так и не вернулся в политику.
Султон Мирзошоев предпочитал писать мемуары, исторические произведения и, самое главное, любил быть с семьей. В прежние годы у него не было много времени на детей, но в последней беседе с Озоди он сказал, что теперь отомстил за прежние годы.
